新疆烤羊肉串的做法如下：
1. 食材准备：准备羊腿肉、羊肥肉、白色洋葱、盐、孜然粉、辣椒粉等材料。
2. 腌制羊肉：将羊腿肉和羊肥肉切成麻将大小的块，将白色洋葱切丝。将羊肉块放在大碗中，加入洋葱丝、盐和少许水，拌匀后用保鲜膜盖好腌制2-3小时入味。
3. 串羊肉：用竹签将腌制好的肉块串起来，一般一串5块羊肉，中间夹一块肥肉，再串两块瘦肉。
4. 烤制：将烤箱预热至250°C，将串好的羊肉串放在烤肉架上，放在烤箱中上层，下面放烤盘。烤制4分钟，取出翻面，再烤2分钟。
5. 调味：在烤好的羊肉串上撒上孜然粉和辣椒粉，即可享用。
正宗的新疆烤羊肉串一般使用白色的洋葱和盐腌制，选用羊瘦肉和一定比例的肥肉，以增加口感的鲜美。腌制过程中，洋葱水可以去除羊肉的腥膻味，使肉质更加鲜嫩。烤制时，使用高温短时间烘烤，可以保持肉质的嫩滑，同时减少烧烤过程中营养素的破坏。
